摘要:研究人員開展了 RARE-seq方法的優化研究。
敏感的游離 RNA(cfRNA)檢測方法有助于進行非侵入性基因表達分析和疾病監測。
這里介紹了 RARE-seq(隨機引物和 cfRNA 片段親和捕獲測序富集分析),這是一種針對 cfRNA 分析優化的方法。研究表明血小板污染會嚴重干擾 cfRNA 分析,并開發出克服該問題的方法。在分析驗證中,發現 RARE-seq 檢測腫瘤來源的 cfRNA 的靈敏度比全轉錄組 RNA 測序(RNA-seq)高約 50 倍,檢測限為 0.05%。

為探究臨床實用性,研究人員對 369 名癌癥患者、非惡性疾病患者和對照組的 437 份血漿樣本進行分析。結果顯示,在 cfRNA 中檢測非小細胞肺癌表達特征的靈敏度隨疾病分期增加(I 期 20 例中有 6 例(30%);II 期 8 例中有 5 例(63%);III 期 15 例中有 10 例(67%);IV 期 96 例中有 80 例(靈敏度 83%,特異性 95%)),且 RARE-seq 比基于腫瘤未知的循環腫瘤 DNA(ctDNA)分析更靈敏。在對酪氨酸激酶抑制劑產生耐藥性的 EGFR 突變非小細胞肺癌患者中,檢測到了組織學轉化和基于突變的耐藥機制。

圖2 血液采集和cfRNA提取的優化
最后,研究還證明了 RARE-seq 在確定腫瘤起源組織、評估良性肺部疾病和追蹤 mRNA 疫苗反應方面的潛在用途。這些結果突出了超靈敏 cfRNA 分析的潛在價值,并為多種臨床應用提供了概念驗證。
參考資料
[1] An ultrasensitive method for detection of cell-free RNA
摘要:研究人員開展了 RARE-seq方法的優化研究。
敏感的游離 RNA(cfRNA)檢測方法有助于進行非侵入性基因表達分析和疾病監測。
這里介紹了 RARE-seq(隨機引物和 cfRNA 片段親和捕獲測序富集分析),這是一種針對 cfRNA 分析優化的方法。研究表明血小板污染會嚴重干擾 cfRNA 分析,并開發出克服該問題的方法。在分析驗證中,發現 RARE-seq 檢測腫瘤來源的 cfRNA 的靈敏度比全轉錄組 RNA 測序(RNA-seq)高約 50 倍,檢測限為 0.05%。

為探究臨床實用性,研究人員對 369 名癌癥患者、非惡性疾病患者和對照組的 437 份血漿樣本進行分析。結果顯示,在 cfRNA 中檢測非小細胞肺癌表達特征的靈敏度隨疾病分期增加(I 期 20 例中有 6 例(30%);II 期 8 例中有 5 例(63%);III 期 15 例中有 10 例(67%);IV 期 96 例中有 80 例(靈敏度 83%,特異性 95%)),且 RARE-seq 比基于腫瘤未知的循環腫瘤 DNA(ctDNA)分析更靈敏。在對酪氨酸激酶抑制劑產生耐藥性的 EGFR 突變非小細胞肺癌患者中,檢測到了組織學轉化和基于突變的耐藥機制。

圖2 血液采集和cfRNA提取的優化
最后,研究還證明了 RARE-seq 在確定腫瘤起源組織、評估良性肺部疾病和追蹤 mRNA 疫苗反應方面的潛在用途。這些結果突出了超靈敏 cfRNA 分析的潛在價值,并為多種臨床應用提供了概念驗證。
參考資料
[1] An ultrasensitive method for detection of cell-free RNA